本发明公开了一种基于计算机模拟获取可调控的TRPV5变异体的方法。所述方法首先采用CHARMM‑GUI对通道蛋白质进行变异处理，随后使用Amber16中的分子动力学模拟模块pmemd.cuda对不同状态下的TRPV5通道蛋白变异体阳离子进行模拟，最后结合使用VMD和Amber16中的cpptraj模块分析阳离子的运动路径，来验证该TRPV5通道蛋白变异体的通道性能。本发明可对整个模拟体系的运动轨迹进行研究解析，克服了中间状态难以连续观测的难题，并且能够直观地观测到阳离子在极短的时间尺度内的运动变化。整个计算过程效率高，耗时短，操作简单，有助于在生物化学、蛋白质工程学等领域的广泛应用。
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来源：北方有色网
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