本发明涉及一种蛋白质结构指纹数据库，属于生物信息学领域。包含四条表示蛋白结构指纹的字符串，由氨基酸序列，蛋白质折叠形状码，物理化学性质和向量偶合组成。所述蛋白质折叠形状码，为27个，由26英文字母加上“$”符号组成，对应27个描述五个连续氨基酸残基的折叠形状的向量；物理化学性质表示每一个氨基酸残基侧链的物理化性质，用7个字符分别表示。相邻的两个肽段共用四个氨基酸形成向量耦合。使用本发明的数据库，可以大大减少数据储存量，加快了检索速度，摆脱必须依赖超级大型计算机或者大量计算机组合资源的局面，可以实现个人电脑运作。
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来源：北方有色网
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